| 施設No. | 施設名 | 取得年 | 更新年 |
|---|---|---|---|
| 1283 | 大分大学医学部附属病院 | 1981 | 2026 |
| 14033 | 医療法人八宏会 有田胃腸病院 | 1994 | 2027 |
| 14034 | 国立病院機構 別府医療センター | 1994 | 2027 |
| 20046 | 大分県厚生連鶴見病院 | 2000 | 2027 |
| 21048 | 独立行政法人国立病院機構 大分医療センター | 2001 | 2025 |
| 24068 | 医療法人敬和会大分岡病院 | 2004 | 2025 |
| 20050105 | 大分県立病院 | 2005 | 2026 |
| 20060079 | 国家公務員共済組合連合会 新別府病院 | 2006 | 2027 |
| 20070099 | 中津市立中津市民病院 | 2007 | 2025 |
| 20090074 | 医療法人慈恵会 西田病院 | 2009 | 2027 |
| 20100068 | 社会医療法人三愛会大分三愛メディカルセンター | 2010 | 2025 |
| 20110074 | 豊後大野市民病院 | 2011 | 2026 |
| 20120040 | 長門記念病院 | 2012 | 2027 |
| 20120041 | 大分赤十字病院 | 2012 | 2027 |
| 20130053 | 特定医療法人 明徳会 佐藤第一病院 | 2013 | 2025 |
| 20130054 | 大分医師会立 アルメイダ病院 | 2013 | 2025 |
| 20130055 | 津久見医師会立 津久見中央病院 | 2013 | 2025 |
| 20190084 | （連携）医療法人新生会 宇佐胃腸内科医院 | 2019 | 2025 |
| 20200113 | （連携）医療法人新生会 高田中央病院 | 2020 | 2026 |
| 20200114 | （連携）医療法人ウェルビーイング あべ胃腸病内視鏡クリニック | 2020 | 2026 |
| 20230060 | （連携）南海医療センター | 2023 | 2026 |
| 20240061 | （連携）国東市民病院 | 2024 | 2027 |
| 20240063 | （連携）臼杵市医師会立コスモス病院 | 2024 | 2027 |
