| 施設No. | 施設名 | 取得年 | 更新年 |
|---|---|---|---|
| 1230 | 独立行政法人国立病院機構 京都医療センター | 1981 | 2026 |
| 1231 | 京都府立医科大学附属北部医療センター | 1986 | 2025 |
| 1233 | 京都大学医学部附属病院 | 1981 | 2026 |
| 2108 | 京都府立医科大学附属病院 | 1982 | 2027 |
| 2109 | 京都第二赤十字病院 | 1994 | 2027 |
| 10019 | 医療法人徳洲会 宇治徳洲会病院 | 1990 | 2026 |
| 13030 | 医療法人医仁会武田総合病院 | 1993 | 2026 |
| 15018 | 愛生会山科病院 | 1995 | 2025 |
| 16023 | 京都きづ川病院 | 1996 | 2026 |
| 16024 | JCHO 京都鞍馬口医療センター | 1996 | 2026 |
| 17027 | 京都第一赤十字病院 | 1997 | 2027 |
| 18019 | 京都桂病院 | 1998 | 2025 |
| 19032 | 医療法人財団康生会 武田病院 | 1999 | 2026 |
| 21032 | 京都中部総合医療センター | 2001 | 2025 |
| 23031 | 医療法人志高会 三菱京都病院 | 2003 | 2027 |
| 23032 | 社会福祉法人京都社会事業財団 西陣病院 | 2003 | 2027 |
| 24048 | 京都市立病院 | 2004 | 2025 |
| 24049 | 日本バプテスト病院 | 2004 | 2025 |
| 20060050 | 京都山城総合医療センター | 2006 | 2027 |
| 20080049 | 洛和会音羽病院 | 2008 | 2026 |
| 20080050 | 医療法人同仁会京都九条病院 | 2008 | 2026 |
| 20080051 | 京都岡本記念病院 | 2008 | 2026 |
| 20130032 | 市立福知山市民病院 | 2013 | 2025 |
| 20150041 | 恩賜財団京都府済生会病院 | 2015 | 2027 |
| 20200063 | 洛和会 丸太町病院 | 2020 | 2026 |
| 20230039 | 京都からすま病院 | 2023 | 2026 |
| 20200065 | （連携）医療法人医修会 新河端病院 | 2020 | 2026 |
| 20200066 | （連携）京都民医連中央病院 | 2020 | 2026 |
| 20200067 | （連携）公益財団法人 丹後中央病院 | 2020 | 2026 |
| 20200068 | （連携）京都田辺中央病院 | 2020 | 2026 |
| 20220062 | （連携）綾部市立病院 | 2022 | 2025 |
| 20230040 | （連携）医療法人福冨士会京都ルネス病院 | 2023 | 2026 |
| 20230041 | （連携）医療法人清仁会洛西ニュータウン病院 | 2023 | 2026 |
